Python子进程：打开的文件太多

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Python子进程：打开的文件太多

python

我正在使用子进程来调用另一个程序，并将其返回值保存到变量中。循环重复此过程，经过数千次后程序崩溃，并出现以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "./extract_pcgls.py", line 96, in <module>
    SelfE.append( CalSelfEnergy(i) )
  File "./extract_pcgls.py", line 59, in CalSelfEnergy
    p = subprocess.Popen(cmd, stdout=subprocess.PIPE, shell=True)
  File "/usr/lib/python3.2/subprocess.py", line 745, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "/usr/lib/python3.2/subprocess.py", line 1166, in _execute_child
    errpipe_read, errpipe_write = _create_pipe()
OSError: [Errno 24] Too many open files

任何解决该问题的想法都非常感谢！

注释提供的代码：

cmd = "enerCHARMM.pl -parram=x,xtop=topology_modified.rtf,xpar=lipid27_modified.par,nobuildall -out vdwaals {0}".format(cmtup[1])
p = subprocess.Popen(cmd, stdout=subprocess.PIPE, shell=True)
out, err = p.communicate()

阅读 210

2020-12-20

共1个答案

小编典典

我猜问题是由于我正在处理带有子进程的打开文件：

cmd = "enerCHARMM.pl -par param=x,xtop=topology_modified.rtf,xpar=lipid27_modified.par,nobuildall -out vdwaals {0}".format(cmtup[1])
p = subprocess.Popen(cmd, stdout=subprocess.PIPE, shell=True)

在此，cmd变量包含刚刚创建但尚未关闭的文件的名称。然后，subprocess.Popen在该文件上调用系统命令。多次执行此操作后，程序崩溃并显示该错误消息。

所以我从中学到的信息是

关闭您创建的文件，然后进行处理

2020-12-20