正如@DavidW指出的那样，对于许多选项，还有一个选项可以对其进行否定/覆盖，而命令行上的最后一个选项“
wins”。因此，例如添加额外的编译选项-Os将否决默认设置-O2或-O3，因为-Os它将-O2在命令行之后出现（-fwrapv/-fno- wrapv这样的对的另一个示例）。

但是，-pthread没有这样的“伙伴”，并且禁用它的唯一机会是完全防止其出现在命令行中。做到这一点的方法有些怪异，但这不是我们所有人都使用python的原因吗？

distutils用于distutils.sysconfig查找正确的编译/链接标志。一种可能性是修改其功能，以便将-pthread其过滤掉。

我选择get_config_vars，但是当然还有其他选择。该计划很简单：

1. wrap distutils.sysconfig.get_config_vars，以便将-pthread其过滤掉
2. distutils.sysconfig.get_config_vars用包装纸代替
3. 否则，setup.py保持不变

这导致以下结果setup.py：

# manipulate get_config_vars:
# 1. step: wrap functionality and filter
from distutils.sysconfig import get_config_vars as default_get_config_vars

def remove_pthread(x):
    if type(x) is str:
        # x.replace(" -pthread ") would be probably enough...
        # but we want to make sure we make it right for every input
        if x=="-pthread":
            return ""
        if x.startswith("-pthread "):
            return remove_pthread(x[len("-pthread "):])
        if x.endswith(" -pthread"):
            return remove_pthread(x[:-len(" -pthread")])
        return x.replace(" -pthread ", " ")
    return x

def my_get_config_vars(*args):
  result = default_get_config_vars(*args)
  # sometimes result is a list and sometimes a dict:
  if type(result) is list:
     return [remove_pthread(x) for x in result]
  elif type(result) is dict:
     return {k : remove_pthread(x) for k,x in result.items()}
  else:
     raise Exception("cannot handle type"+type(result))

# 2.step: replace    
import distutils.sysconfig as dsc
dsc.get_config_vars = my_get_config_vars


# 3.step: normal setup.py

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

from distutils.extension import Extension

extensions = [Extension("foo",sources = ["foo.pyx"])]

setup(ext_modules = cythonize(extensions))

我不确定，-pthread在不使用python解释器构建并加载结果模块的情况下，这是一个好主意-pthread-不确定它不会以某些细微的方式破坏并按预期工作。