numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError: Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found. Directories to search for the libraries can be specified in the numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting the BLAS environment variable.
我需要从该站点下载哪个tar?
我已经尝试过fortrans,但是一直出现此错误(明显地设置了环境变量之后)。
该SciPy的网页用来提供构建和安装说明,但说明现在依靠操作系统二进制分发。要在没有预编译所需库软件包的操作系统上构建SciPy(和NumPy),必须先构建然后静态链接到Fortran库BLAS和LAPACK:
mkdir -p ~/src/ cd ~/src/ wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz tar xzf blas.tgz cd BLAS-* ## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy. ## For GNU compiler on 32-bit systems: #g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f # with g77 #gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f # with gfortran ## OR for GNU compiler on 64-bit systems: #g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with g77 gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with gfortran ## OR for Intel compiler: #ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f # Continue below irrespective of compiler: ar r libfblas.a *.o ranlib libfblas.a rm -rf *.o export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a
仅执行五个g77 / gfortran / ifort命令之一。除了我使用的gfortran之外,我已经全部注释掉了。随后的LAPACK安装需要一个Fortran 90编译器,并且由于两个安装都应使用相同的Fortran编译器,因此g77不应用于BLAS。
接下来,您需要安装LAPACK东西。SciPy网页的说明在这里也对我有所帮助,但我必须对其进行修改以适合我的环境:
mkdir -p ~/src cd ~/src/ wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz tar xzf lapack.tgz cd lapack-*/ cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc # On Linux with lapack-3.2.1 or newer make lapacklib make clean export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a
2015年9月3日更新:今天验证了一些评论(感谢所有):运行之前,make lapacklib编辑make.inc文件-fPIC并向OPTS和NOOPT设置添加选项。如果您使用的是64位体系结构或要编译为64位体系结构,请同时添加-m64。重要的是,在将这些选项设置为相同的值的情况下编译BLAS和LAPACK。如果您忘记了,-fPICSciPy实际上会给您有关符号丢失的错误,并建议您使用此开关。make.inc我的设置中的特定部分如下所示:
make lapacklib
make.inc
-fPIC
OPTS
NOOPT
-m64
FORTRAN = gfortran OPTS = -O2 -frecursive -fPIC -m64 DRVOPTS = $(OPTS) NOOPT = -O0 -frecursive -fPIC -m64 LOADER = gfortran
在旧机器(例如RedHat 5)上,gfortran可能安装在旧版本(例如4.1.2)中,并且不理解option -frecursive。make.inc在这种情况下,只需将其从文件中删除即可。
-frecursive
Makefile的lapack测试目标在我的设置中失败,因为它找不到blas库。如果您周全,则可以暂时将blas库移至指定位置以测试lapack。我是一个懒惰的人,所以我相信开发人员可以使其工作并仅在SciPy中进行验证。