我正在删除旧答案，因为这可能会导致数据丢失。如ozan所述，我们可以在每个应用中创建2个迁移。这篇文章下面的评论是我的旧答案。

第一次迁移以从第一个应用中删除模型。

$ python manage.py makemigrations old_app --empty

编辑迁移文件以包括这些操作。

class Migration(migrations.Migration):

    database_operations = [migrations.AlterModelTable('TheModel', 'newapp_themodel')]

    state_operations = [migrations.DeleteModel('TheModel')]

    operations = [
      migrations.SeparateDatabaseAndState(
        database_operations=database_operations,
        state_operations=state_operations)
    ]

第二次迁移取决于第一次迁移并在第二个应用程序中创建新表。将模型代码移至第二个应用程序后

$ python manage.py makemigrations new_app

然后将迁移文件编辑为类似的内容。

class Migration(migrations.Migration):

    dependencies = [
        ('old_app', 'above_migration')
    ]

    state_operations = [
        migrations.CreateModel(
            name='TheModel',
            fields=[
                ('id', models.AutoField(verbose_name='ID', serialize=False, auto_created=True, primary_key=True)),
            ],
            options={
                'db_table': 'newapp_themodel',
            },
            bases=(models.Model,),
        )
    ]

    operations = [
        migrations.SeparateDatabaseAndState(state_operations=state_operations)
    ]