如何找出 R 中加载了哪个包版本？

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如何找出 R 中加载了哪个包版本？

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我正在弄清楚如何使用我的大学集群。它安装了 2 个版本的 R。系统范围的 R 2.11 (Debian 6.0) 和 R 2.14.2 在非标准位置。

我正在尝试将 MPI 与雪一起使用。我试图运行的代码如下

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在 R 2.11 上没有问题。（我用启动脚本mpirun -H localhost,n1,n2,n3,n4 -n 1 R --slave -f code.R）。现在，当我尝试使用 R 2.14.2 执行此操作时，我收到以下消息：

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以看起来 R 加载了为 R 2.11 编译的包雪版本。我已将 R 2.14 下的 snow 安装到我的主文件夹中，并将以下几行添加到我的代码中：

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行 R 2.14.2，并且我的 R 包文件夹位于搜索路径的首位。但我仍然得到错误。

所以我的问题是如何确定 R 中加载了哪个版本的包？我可以看到
installed.packages所有已安装的软件包，所以也许有一些功能列出了已加载软件包的类似信息？

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2022-03-13

共1个答案

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你可以用它sessionInfo()来实现。

> sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

attached base packages:
[1] graphics  grDevices utils     datasets  stats     grid      methods   base

other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.0  reshape2_1.2.1 plyr_1.7.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.1-1   dichromat_1.2-4    digest_0.5.2       MASS_7.3-18        memoise_0.1        munsell_0.3       
 [7] proto_0.3-9.2      RColorBrewer_1.0-5 scales_0.2.0       stringr_0.6       
>

但是，根据评论和下面的答案，有更好的选择

> packageVersion("snow")

[1] “0.3.9”

要么：

"Rmpi" %in% loadedNamespaces()

2022-03-13