我想使用IPython 笔记本作为交互式分析我使用 BiopythonGenomeDiagram模块制作的一些基因组图表的一种方式。虽然有大量关于如何matplotlib在 IPython 笔记本中使用内联图形的文档,但 GenomeDiagram 使用 ReportLab 工具包,我认为 IPython 中的内联图形不支持该工具包。
GenomeDiagram
matplotlib
然而,我在想,解决这个问题的一种方法是将绘图/基因组图写到一个文件中,然后打开内联图像,这将具有相同的结果,如下所示:
gd_diagram.write("test.png", "PNG") display(file="test.png")
但是,我无法弄清楚如何做到这一点 - 或者知道它是否可能。那么有谁知道图像是否可以在 IPython 中打开/显示?
感谢这篇文章,您可以执行以下操作:
from IPython.display import Image Image(filename='test.png')
(官方文档)