感谢 Jeremy，我发现了如何自己重新激活存储库。基本上，需要两个步骤：

1. 将（已经存在的）本地存储库添加到 EGit 的Git Repositories视图中；
2. 使用“使用或创建存储库”再次“共享”每个项目。

如果存储库视图中的存储库不可用，则第二步将不起作用。因此，在 Eclipse 升级后，请执行以下操作：

将（已经存在的）本地存储库添加到 EGit 的Git Repositories视图

• 打开Git Repositories视图：
• 点击“添加”按钮（工具提示Add an existing local Git Repository to this view：）
• 在“添加 Git 存储库”对话框中，在 下Search criteria，进入工作区目录，选择“ Look for nested repositores”，然后点击Search：
• 选择要添加的存储库并单击OK

使用“使用或创建存储库”再次“共享”每个项目

• 在 Eclipse 中打开现有项目Project explorer；
• 右键单击并选择“ Team-> Share Project...”：
• 选择 Git Project，然后在下一个对话框中选择“ Use or create Repository in parent folder of project”。重要提示：不要尝试Use or create Repository in parent folder of project从未选择“”时可见的组合框中选择存储库 - 它不起作用。

该向导会建议位于当前项目中的本地 git 存储库，因此只需点击Finish.