numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError: Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found. Directories to search for the libraries can be specified in the numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting the BLAS environment variable.
我需要从这个站点下载哪个 tar?
我已经尝试过fortrans,但我一直收到这个错误(显然在设置环境变量之后)。
SciPy 网页曾经提供构建和安装说明,但现在那里的说明依赖于 OS 二进制发行版。要在没有所需库的预编译包的操作系统上构建 SciPy(和 NumPy),您必须构建然后静态链接到 Fortran 库BLAS和LAPACK:
mkdir -p ~/src/ cd ~/src/ wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz tar xzf blas.tgz cd BLAS-* ## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy. ## For GNU compiler on 32-bit systems: #g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f # with g77 #gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f # with gfortran ## OR for GNU compiler on 64-bit systems: #g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with g77 gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with gfortran ## OR for Intel compiler: #ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f # Continue below irrespective of compiler: ar r libfblas.a *.o ranlib libfblas.a rm -rf *.o export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a
只执行五个 g77/gfortran/ifort 命令之一。我已经注释掉了所有,但我使用的 gfortran。随后的 LAPACK 安装需要Fortran 90编译器,并且由于两个安装都应使用相同的 Fortran 编译器,因此不应将 g77 用于 BLAS。
接下来,您需要安装 LAPACK 的东西。SciPy 网页的说明在这里也帮助了我,但我必须修改它们以适应我的环境:
mkdir -p ~/src cd ~/src/ wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz tar xzf lapack.tgz cd lapack-*/ cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc # On Linux with lapack-3.2.1 or newer make lapacklib make clean export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a
2015 年 9 月 3 日更新:今天验证了一些评论(感谢所有人):在运行之前make lapacklib编辑make.inc文件并添加-fPIC选项OPTS和NOOPT设置。如果您在 64 位架构上或想要编译一个,还添加-m64. 重要的是,在编译 BLAS 和 LAPACK 时将这些选项设置为相同的值。如果你忘记了-fPICSciPy 实际上会给你一个关于缺少符号的错误,并且会推荐这个开关。在我的设置中,具体部分make.inc如下所示:
make lapacklib
make.inc
-fPIC
OPTS
NOOPT
-m64
FORTRAN = gfortran OPTS = -O2 -frecursive -fPIC -m64 DRVOPTS = $(OPTS) NOOPT = -O0 -frecursive -fPIC -m64 LOADER = gfortran
在旧机器(例如 RedHat 5)上,gfortran 可能安装在旧版本(例如 4.1.2)中并且不理解 option -frecursive。在这种情况下,只需将其从make.inc文件中删除即可。
-frecursive
Makefile 的 lapack 测试目标在我的设置中失败,因为它找不到 blas 库。如果你很彻底,你可以暂时将 blas 库移动到指定位置来测试 lapack。我是一个懒惰的人,所以我相信开发人员可以让它工作并仅在 SciPy 中进行验证。