在J2EE应用程序中，模块根据其功能打包为EAR，JAR和WAR。

JAR：包含企业Java Bean（类文件）和EJB部署描述符的EJB模块打包为具有.jar扩展名的JAR文件。

WAR：包含Servlet类文件，JSP文件，支持文件，GIF和HTML文件的Web模块打包为具有.war（Web存档）扩展名的JAR文件。

EAR：以上所有文件（.jar和.war）都打包为扩展名为.ear（企业归档）的JAR文件，并部署到Application Server中。

一个WAR（Web归档）是被加载到一个模块Web容器 A的Java应用服务器。Java Application Server具有两个容器（运行时环境）-一个是Web容器，另一个是EJB容器。

的Web容器基于JSP或Servlet的API主机的Web应用程序-用于网络请求处理专门设计-这样的一个多分布式计算请求/响应样式。Web容器要求将Web模块打包为WAR文件 -这是一个特殊的JAR文件，web.xml文件WEB-INF夹中有一个文件。

一个EJB容器基于EJB的API旨在提供扩展的业务功能，如声明式事务，声明方法级别的安全性和多协议支持主机企业Java Beans -这样的更多的RPC风格的分布式计算。EJB容器要求将EJB模块打包为JAR文件 -这些ejb-jar.xml文件在META-INF文件夹中有一个文件。

企业应用程序可以包含一个或多个模块，这些模块可以是Web模块（打包成WAR文件），EJB模块（打包成JAR文件）或它们两者。企业应用程序打包为EAR文件 -这些是特殊的JAR application.xml文件，在META-INF文件夹中包含一个文件。

基本上，EAR文件是包含WAR文件和JAR文件的超集。Java Application Server允许在WAR文件中部署独立的Web模块，尽管在内部，它们创建EAR文件作为WAR文件的包装。诸如Tomcat和Jetty之类的独立Web容器不支持EAR文件-这些不是成熟的Application Server。这些容器中的Web应用程序仅应作为WAR文件进行部署。

在应用程序服务器中，EAR文件包含诸如Web模块的应用程序安全角色映射，EJB参考映射和上下文根URL映射之类的配置。

除了Web模块和EJB模块之外，EAR文件还可以包含打包为RAR文件的连接器模块和打包为JAR文件的客户端模块。