我有一个Tomcat 7在Linux中运行的操作系统，可以$CATALINA_HOME/bin/startup.sh通过$CATALINA_HOME/bin/shutdown.sh
来启动和关闭/etc/init.d

除了1个问题，其他都还可以。有时tomcat不会停止。
尽管我停止了它，并且在catalina.out日志中看到了正在下降的日志，但是如果我这样做，ps -ef仍然可以看到该进程正在运行。

可能是什么问题呢？我该如何调试？我的感觉是，这与线程有关。

因此，以下是可疑部分：
1）我使用Log4j的LogManager来检测log4j配置是否已更改，但是我Log4jManager.shutdown
在contextDestroyed ServletContextListener
2）上使用H2数据库，然后在关机时看到：

严重：Web应用程序[/ MyApplication]似乎已启动
名为[H2 Log Writer MYAPPLICATION] 的线程，但未能停止该线程。
这很可能造成内存泄漏

严重：Web应用程序[/ MyApplication]似乎已启动
名为[H2 File Lock Watchdog
/opt/myOrg/tomcat/webapps/MyApplication/db/myDatabase.lock.db] 的线程，但
未能停止。这很可能造成内存泄漏。
2012年4月2 日，上午9:08:08 org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader
clearReferencesThreads严重：Web应用程序[/ MyApplication]
似乎已启动名为[FileWatchdog]的线程，但未能
将其停止。这很可能造成内存泄漏。

有什么帮助吗？我如何在这里发现问题？

更新：
我kill -3按照@daveb的建议进行了操作，在catalina.out中，我看到了：

JVMDUMP006I正在处理转储事件“用户”，详细信息“”-请稍候。JVMDUMP032I
JVM使用’/etc/init.d/javacore.20120402.093922.2568.0001.txt’请求Java转储，以响应事件JVMDUMP010I
Java转储写入/etc/init.d/javacore.20120402.093922.2568.0001.txt
JVMDUMP013I处理的转储事件“用户”，详细信息“”。

有一个javacore，/etc/init.d但我不知道如何处理它。即我应该调查哪些部分