小编典典

使用“ |”进行grepping 替代运算符

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以下是一个名为AT5G60410.gff的大文件的示例:

Chr5    TAIR10  gene    24294890    24301147    .   +   .   ID=AT5G60410;Note=protein_coding_gene;Name=AT5G60410
Chr5    TAIR10  mRNA    24294890    24301147    .   +   .   ID=AT5G60410.1;Parent=AT5G60410;Name=AT5G60410.1;Index=1
Chr5    TAIR10  protein 24295226    24300671    .   +   .   ID=AT5G60410.1-Protein;Name=AT5G60410.1;Derives_from=AT5G60410.1
Chr5    TAIR10  exon    24294890    24295035    .   +   .   Parent=AT5G60410.1
Chr5    TAIR10  five_prime_UTR  24294890    24295035    .   +   .   Parent=AT5G60410.1
Chr5    TAIR10  exon    24295134    24295249    .   +   .   Parent=AT5G60410.1
Chr5    TAIR10  five_prime_UTR  24295134    24295225    .   +   .   Parent=AT5G60410.1
Chr5    TAIR10  CDS 24295226    24295249    .   +   0   Parent=AT5G60410.1,AT5G60410.1-Protein;
Chr5    TAIR10  exon    24295518    24295598    .   +   .   Parent=AT5G60410.1

我在使用grep从中提取特定行时遇到了一些麻烦。我想提取所有在第三列中指定的“基因”或“外显子”类型的行。当这不起作用时,我感到很惊讶:

grep 'gene|exon' AT5G60410.gff

没有结果返回。我哪里出问题了?


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2020-06-07

共1个答案

小编典典

您需要逃脱|。以下应做的工作。

grep "gene\|exon" AT5G60410.gff
2020-06-07